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血液總RNA提取試劑程序

發(fā)布時(shí)間: 2023-01-10  點(diǎn)擊次數(shù): 572次

血液總RNA提取試劑程序

 

 

描述:血液總RNA提取試劑特別加強(qiáng)了對(duì)液體標(biāo)本如全血等RNA的提取能力。直接將液體標(biāo)本與血液總RNA提取試劑混合即可,極大簡(jiǎn)化了樣品的提取前處理過(guò)程。并且其提取能力強(qiáng)大,甚至可以從已經(jīng)凝固的血液塊中提取出高純度的RNA。使用方法與RNAtrip 和TRIzol相似,可在30-60分鐘內(nèi)完成。獲得的高純度總RNA可用于RT-PCR、Northern Blot、RNA酶保護(hù)、Poly(A) mRNA純化、體外翻譯等實(shí)驗(yàn)。 

 

儲(chǔ)存:4oC密封避光保存一年以上有效。
適用:液體標(biāo)本(200µl/ml): 全血、體液、尿液,懸浮細(xì)胞、病毒微生物樣品等。

 

RNA提取程序
液體標(biāo)本:全血、體液、尿液,懸浮細(xì)胞、病毒微生物樣品等。每200ml液體樣品加1 ml RNAtrip LS,置冰上。未抗凝的凝固血液按固體組織處理。
1. 將裂解物轉(zhuǎn)移到1.5 ml離心管,置冰上10分鐘。如需暫停操作,裂解物可凍存于-70 oC至少一個(gè)月。
2. 加入0.2體積的氯仿(0.2ml),充分顛倒混勻,冰上孵育1-5 分鐘,溶液開(kāi)始分相。有時(shí)分相不明顯,不影響提取。
離心12,000g 4 oC 10 分鐘,溶液分為兩相。RNA保留于上層無(wú)色透明水相約0.6ml,下層為有機(jī)相,兩相界面是一層薄膜其厚度與組織細(xì)胞類(lèi)型和多少有關(guān)。小心吸出上層水相轉(zhuǎn)移到新離心管,但應(yīng)留0.5-1 mm厚水相,以免擾動(dòng)和吸入下面的碎片和無(wú)機(jī)相。如吸入無(wú)機(jī)相和碎片,應(yīng)將所取水相放回管中并重新離心10分鐘,再吸取水相。這一點(diǎn)至關(guān)重要,違背此原則容易導(dǎo)致RNA降解和DNA污染。
3. 加入等體積異丙醇(0.5ml)于含有上清的新離心管中,充分混勻。冰上孵育10 分鐘綽綽有余。但-20 oC 放置一至數(shù)小時(shí),可回收幾乎所有的RNA。如需盡可能多的RNA,或起始組織細(xì)胞的量很少,或用戶需要暫停操作時(shí),可以這樣做。用更低的溫度和更長(zhǎng)的時(shí)間進(jìn)行沉淀并不必要。
4. 離心, 12,000g,4 oC,10分鐘。小心棄上清,管底可見(jiàn)少許黃白色RNA沉淀。如初始組織細(xì)胞量少,RNA沉淀用肉眼幾乎難辨,但不影響實(shí)驗(yàn)。
5. 洗滌沉淀。立即加入1 ml 75%乙醇,顛倒混勻數(shù)次,12,000g 5分鐘。棄上清,盡量吸去管壁上的液體。乙醇洗滌后RNA沉淀容易漂浮,勿倒掉RNA沉淀。此時(shí)可將RNA沉淀保存在75%乙醇中,4 oC一周或-20 oC一年。
6. 敞開(kāi)管口空氣干燥5-10分鐘,RNA沉淀干燥至膠凍狀即可。過(guò)分干燥將使RNA難以溶解。用50-100 ml DEPC處理的高壓消毒純水或TE溶解沉淀。如RNA難溶,可55 oC加熱10分鐘,或反復(fù)凍融數(shù)次助溶。RNA溶液可保存于-70 oC或液氮中;或加3倍體積乙醇-20 oC凍存,用時(shí)離心沉淀。
7. 測(cè)定OD值。計(jì)算RNA濃度和OD260/280比值。RNAtrip LS提取的RNA絕少蛋白污染,比值通常在1.6-2.0之間均屬正常。OD260/280比值受很多因素影響。起始組織量過(guò)大或RNAtrip LS試劑過(guò)少,或吸取了有機(jī)相或碎片,將使OD260/280比值降低,應(yīng)預(yù)以避免;RNA用水溶解或pH偏酸OD260/280偏低,而用TE或離子強(qiáng)度較高的溶液溶解時(shí)該比值較高,但均不影響RNA使用。用戶應(yīng)該知道,即便是已降解的RNA,該比值也能達(dá)到看似完-美的2.0左右,因此該比值并非判斷RNA降解與否的指標(biāo)。可進(jìn)行RNA瓊脂糖電泳檢查RNA完整性(見(jiàn)說(shuō)明2)。

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